La importancia de los nematodos es variada, principalmente medico-veterinario y agrícola, debido a que parasitan humanos, animales domésticos y plantas cultivadas. Muchas especies son de vida libre, jugando un papel importante en los ecosistemas. La participación de los nematodos en muchos eslabones funcionales de la red alimentaria planctónica también los convierte en marcadores de muchos procesos ecológicos y biológicos, como el mantenimiento del ciclo de nutrientes o el control de plagas.
Por ejemplo, los nematodos del suelo constituyen un grupo de invertebrados de gran importancia ecológica, cuyas características los convierten en valiosas herramientas como biomarcadores. Su diversidad taxonómica y funcional, abundancia y prevalencia inusuales, y la rápida respuesta de las comunidades de nematodos a las perturbaciones ambientales, como la labranza o los insumos químicos, han convertido a las colonias de nematodos en un indicador importante para evaluar la efectividad del manejo agrícola en los ecosistemas.
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